A Secretaria Geral é um órgão executivo, subordinado à Reitoria, responsável pela expedição dos atos legais institucionais internos, organização e gerenciamento dos processos submetidos aos Colegiados Superiores, pelas solenidades de colação de grau e pelo registro dos diplomas. Os colegiados superiores estão vinculados aos órgãos da administração superior da Universidade, descritos no Artigo 6º do Estatuto. São eles: Conselho Universitário
CONSU e Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão – CONSEPE. A responsabilidade da Secretaria Geral em relação a estes conselhos é de organizar sua composição, observando a vigência de mandato dos membros que os compõem de acordo com o Estatuto; elaborar os calendários de reuniões anuais; gerenciar os processos submetidos aos referidos conselhos; distribui-los entre os membros para análise e parecer, bem como expedir os atos legais que os aprovam, registrados em ata, e disponibilizá-los à comunidade acadêmica.
A Secretaria de Controle e Registros Acadêmicos, para a consecução dos processos internos da Universidade, é responsável pelas seguintes atividades: cadastro de matrizes curriculares; parametrizações dos períodos para matrículas, cadastros das parametrizações de faltas e notas; expedição de documentos, tais como: histórico escolar, declarações diversas, certificados, conteúdos programáticos, diplomas, exceto a fase de registro, apostilamentos em diplomas; cadastro de dispensas de disciplinas após análises e concessões; transferências diversas de alunos (curso, campus, turma e turno); conferência e revisão das análises curriculares realizadas por transferências de outras Instituições e de candidatos já diplomados ; acompanhamento do lançamento